L'objectif est de trouver le meilleur innovateur parmi 10 candidats très intelligents, et le processus d'élimination commence immédiatement. L'équipe qui réussit le défi de chaque épisode est sauvée, tandis qu'un membre de l'équipe perdante est éliminé. Le vainqueur général de The Big Brain Theory: Pure Genius remporte 50 000 $.