Carl Matthews est coincé. À 45 ans, sa vie est devenue une routine. Chaque matin, Carl se bat pour monter dans le train de 7h39 où il voit les mêmes visages malheureux faire le même trajet quotidien vers Waterloo. Heureusement marié à Maggie, son amie d'université, avec qui il a deux adolescents en bonne santé, quoique maussades, la vie de Carl est devenue prévisible.
Sally Thorn a récemment quitté Londres, où elle travaille toujours comme directrice d'un club de remise en forme. Mais elle n'est pas sûre d'aimer sa nouvelle vie de banlieue, ni la perspective d'épouser Ryan, un beau coach sportif. Ryan est désespéré à l'idée de fonder une famille, de se marier, de s'installer. Sally se demande secrètement s'il est vraiment l'homme qu'il lui faut. Non pas qu'elle ait beaucoup de temps pour s'en préoccuper, surtout quand elle court pour attraper le 7h39.
Lors d'une dispute pour une place assise, Sally et Carl commencent à discuter et soudain, leurs trajets quotidiens en train deviennent beaucoup plus intéressants.
Le 7h39 est l'histoire de la façon dont même la vie la plus prévisible peut, en un instant fugace, changer radicalement de cap.