Adolescente profondément perturbée, Nikita a été sauvée de la peine de mort par une agence secrète américaine connue uniquement sous le nom de Division, qui l'a formée comme espionne et assassin. Nikita a finalement été trahie par les seules personnes en qui elle pensait pouvoir avoir confiance. Aujourd'hui, après trois ans de clandestinité, Nikita cherche à se venger et fait clairement comprendre à son ancien patron, Percy, ainsi qu'à ses anciens amis, Michael et Birkhoff, qu'elle est prête à tout pour exposer et détruire leur opération secrète.