L'histoire suit Tadayasu Sawaki (interprété par Nakamura Yuichi), étudiant à l'université et deuxième fils d'un producteur de miso. Il intègre l'Université d'Agriculture de Tokyo et découvre bientôt qu'il peut voir les microorganismes apparaître sous la forme de personnages étranges. Plus encore, il peut communiquer avec les bactéries qui l'entourent.