Ambientada varios años después de la anterior serie de Yu-Gi-Oh!, GX sigue a una nueva generación de duelistas en la prestigiosa Academia de Duelos, ¡una escuela internado de alta competencia donde los lápices y libros han sido reemplazados por Discos de Duelo y cartas de monstruos! Aún así, para estos estudiantes prometedores, no se trata solo de aprobar los exámenes, ¡sino de convertirse en el próximo Rey de los Juegos!