Los habitantes del planeta Thundera evacúan justo antes de que sea destruido. Fueron perseguidos por una banda de mutantes. Todos sus naves de escape, excepto una, fueron destruidas. Solo un pequeño grupo de Thunderianos (ThunderCats) quedó. Con solo la mitad de la potencia del motor, el grupo, liderado por Jaga, tuvo que dirigirse al planeta más cercano. Jaga comandó su nave mientras los otros 7 estaban en sus tubos de estasis. Jaga murió en su viaje a la Tercera Tierra y su nave se estrelló allí. Pronto hicieron amigos con varios grupos de la zona y diseñaron una fortaleza. Mumm-Ra, la encarnación milenaria del mal, junto con los mutantes que destruyeron al resto de los Thunderianos, son una amenaza constante. Pero Lion-O, el nuevo líder de los ThunderCats, con su arma la "Espada del Augurio", ayudará a los ThunderCats a tener una oportunidad.