Manteniéndose fiel a la premisa de la serie original: Lion-O y los ThunderCats —Tygra, Panthro, Cheetara, Wilykat y Wilykit— apenas escapan de la repentina destrucción de su mundo natal, Thundera, solo para estrellarse en el misterioso y exótico planeta de la Tercera Tierra. Lion-O, el recién nombrado Señor de los ThunderCats, intenta liderar al equipo mientras hacen de este planeta su nuevo hogar. Una extraña hueste de criaturas y villanos se interponen en su camino, incluido el malvado Mumm-Ra, el perverso gobernante de la Tercera Tierra que no permitirá que nada, incluidos los ThunderCats, detenga su reinado tiránico sobre el planeta.