La historia se desarrolla en un mundo donde la gente continúa su guerra contra lo "desconocido", el enemigo de la humanidad. Niños que fueron evacuados a una instalación de sueño criogénico durante la invasión de lo "desconocido" hace varias décadas, despiertan de su letargo y descubren que sus cuerpos han desarrollado algunas fuerzas sobrenaturales. Para proteger al país de lo "desconocido" que emerge de la puerta de la bahía de Tokio, los niños y niñas libran batallas en defensa de las ciudades de Tokio, Kanagawa y Chiba.