Persona -trinity soul- transcurre diez años después del final de Persona 3. Está ambientada en la ciudad de Ayanagi, una urbe situada cerca del Mar de Japón, y su fuerza policial comienza a investigar varios casos relacionados con una misteriosa enfermedad llamada el Síndrome de la Apatía. En medio de la crisis, dos hermanos llamados Shin y Jun Kanzato regresan a Ayanagi para ver a su hermano mayor Ryō, quien ahora es el Superintendente de la Policía de la Ciudad de Ayanagi. Han pasado diez años desde la última vez que los tres hermanos se vieron.