En un futuro cercano de Japón, aparecen monstruos grotescos llamados "Mushi". Infectan a las personas, otorgándoles poderes sobrenaturales. Los "Mushitsuki", los anfitriones de los Mushi, son temidos, despreciados y abandonados por la sociedad... o son asesinados por los Mushi. En medio de esto, el estudiante de secundaria Kusuriya Daisuke se encuentra con una chica de camino a la escuela a la que acaba de transferirse. De alguna manera, él y la chica, Anmoto Shiika, que está allí parada en el cruce de ferrocarril, se sienten atraídos el uno por el otro. Como si reconocieran en el otro aquello que les falta, su relación se profundiza rápidamente. Sin embargo, Shiika es una fugitiva de GARDEN, un asilo secreto para Mushitsuki. Tokkan, o la Agencia Especial de Preservación del Medio Ambiente, responsable de encontrar Mushitsuki y confinarlos en el asilo, ordena a Kakko, su mejor agente y Mushitsuki más fuerte, que la cace.