¡La preciosa e incomparable presidenta del consejo estudiantil, Medaka Kurokami, resuelve los problemas de todos! Medaka Kurokami, quien acaba de convertirse en la 98ª presidenta del consejo estudiantil de Sandbox Academy, instala un buzón de sugerencias tal como lo prometió en su campaña electoral. "Tus sueños te pertenecen. Ve tras ellos y hazlos realidad tú mismo. Tus preocupaciones, sin embargo, me pertenecen a mí. ¡¡Envíamelas todas!!" Mientras Medaka resuelve los problemas de sus compañeros junto a su amigo de la infancia, Zenkichi Hitoyoshi, su buzón de sugerencias, apodado la Medaka Box, gana gran popularidad entre los estudiantes.