Un día, mientras juegan al juego en línea Elder Tales, 30.000 jugadores se encuentran repentinamente atrapados en otro mundo. Allí, Shiroe, un jugador veterano de ocho años, también se queda atrás. Los jugadores atrapados siguen vivos, pero permanecen en combate con los monstruos. Los jugadores no entienden lo que les ha sucedido y huyen a Akiba, la ciudad más grande de Tokio, donde se ven sumidos en el caos. Shiroe, que una vez se enorgulleció de su estilo de vida solitario, forma un gremio llamado Log Horizon con su viejo amigo Naotsugu, la asesina Akatsuki y otros.