La Mayor Motoko Kusanagi es una hermosa pero letal cyborg que es la líder del escuadrón de la Sección 9, la unidad clandestina del gobierno japonés encargada de combatir el terrorismo y la guerra cibernética. Rodeada de un equipo altamente capacitado, Motoko enfrenta su desafío más grande: el Hombre Riendo, un terrorista que orquestó un complot de secuestro y extorsión hace muchos años y que ha reaparecido de repente. Para descubrir la identidad de este enigmático criminal, Motoko y la Sección 9 se ven arrastrados a un laberinto mortal y tendrán que utilizar toda su experiencia para sobrevivir.