Ein geheimer Regierungsplan, historische Figuren auszugraben und sie zu klonen, hat funktioniert. Es sind 16 Jahre vergangen, und die Klone sind jetzt in der High School. Die fünf Hauptfiguren sind Abe Lincoln, ein durchweg netter, aber naiver Typ, der nach dem Schul-Sexsymbol Cleopatra schmachtend ist, die mit dem machohaften JFK zusammen ist. Außerdem sind Abes zwei beste Freunde Joan von Arc, ein von Ängsten geplagtes Goth-Mädchen, das in ihn verliebt ist, und Gandhi, ein unermüdlicher Partylöwe. Clone High geht mutig schwierige Teenager-Themen an, wie Schlafmangel, das Anstecken von ADHS durch Toilettensitze, die Übel des Mülls und die Herausforderung, dass der Typ, den man mag, nicht auf die gleiche Weise zurückliebt. Wird Abe mit Cleo zusammenkommen oder von dem gutaussehenden JFK aufgehalten werden? Wird Joan es endlich schaffen, dass Abe sie bemerkt? Wer kann das schon sagen?