Annika folgt der scharfsinnigen, witzigen und rätselhaften DI Annika Strandhed, die eine neue, spezialisierte Marine Homicide Unit (MHU) leitet. Diese Einheit ist dafür zuständig, die unerklärlichen, brutalen und scheinbar unfassbaren Morde zu untersuchen, die in den schottischen Wasserwegen angespült werden. Im Laufe der Serie macht Annika das Publikum zu ihrer Vertrauten, indem sie die vierte Wand durchbricht und ihre trockenen Beobachtungen zu den Fällen und ihrem Leben teilt, während sie ihr brillantes, aber unkonventionelles Team und ihre ebenso brillante, aber komplexe jugendliche Tochter managt.