Alert: Missing Persons Unit ist ein Krimi-Drama über die Abteilung für Vermisstenfälle (MPU) des Polizeipräsidiums von Philadelphia. Jede Folge zeigt eine atemlose Suche nach einem vermissten Menschen, bei der es um Leben und Tod geht und die parallel zu Jason Grant und Nikki Batistas fortlaufender Suche nach der Wahrheit über ihren lange verschollenen Sohn verläuft.