تدور أحداث "بيرسونا - ترينيتي سول" بعد عشر سنوات من نهاية "بيرسونا 3". تدور أحداثها في مدينة أياناغي، وهي مدينة تقع بالقرب من بحر اليابان، وتبدأ قوات الشرطة فيها التحقيق في عدة قضايا تتعلق بمرض غامض يسمى "متلازمة اللامبالاة". في خضم الأزمة، يعود شقيقان يدعيان شين وجون كانزاتو إلى أياناغي لرؤية شقيقهما الأكبر ريو، الذي أصبح الآن قائد شرطة مدينة أياناغي. لقد مرت عشر سنوات منذ أن التقى الأشقاء الثلاثة ببعضهم البعض آخر مرة.